Index B | C | D | E | F | G | I | L | M | O | P | R | S | T | V B BFXPipeline (class in bionty) bionty module Bionty (class in bionty) BiontyField (class in bionty) BioSample (class in bionty) C CellLine (class in bionty) CellMarker (class in bionty) CellType (class in bionty) D DevelopmentalStage (class in bionty) df() (bionty.BFXPipeline method) (bionty.Bionty method) (bionty.Organism method) diff() (bionty.Bionty method) Disease (class in bionty) display_available_sources() (in module bionty) display_currently_used_sources() (in module bionty) Drug (class in bionty) E Ethnicity (class in bionty) ExperimentalFactor (class in bionty) F fields (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.BioSample attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.DevelopmentalStage attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Ethnicity attribute) (bionty.ExperimentalFactor attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Organism attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Tissue attribute) G Gene (class in bionty) get_term() (bionty.Ontology method) I inspect() (bionty.Bionty method) L lookup() (bionty.Bionty method) M map_legacy_ids() (bionty.Gene method) map_synonyms() (bionty.Bionty method) module bionty O Ontology (class in bionty) organism (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.BioSample attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.DevelopmentalStage attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Ethnicity attribute) (bionty.ExperimentalFactor attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Organism attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Tissue attribute) Organism (class in bionty) P Pathway (class in bionty) Phenotype (class in bionty) Protein (class in bionty) R reset_sources() (in module bionty) S search() (bionty.Bionty method) settings (in module bionty) source (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.BioSample attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.DevelopmentalStage attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Ethnicity attribute) (bionty.ExperimentalFactor attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Organism attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Tissue attribute) standardize() (bionty.Bionty method) T Tissue (class in bionty) to_df() (bionty.Ontology method) V validate() (bionty.Bionty method) version (bionty.BFXPipeline attribute) (bionty.Bionty attribute) (bionty.BioSample attribute) (bionty.CellLine attribute) (bionty.CellMarker attribute) (bionty.CellType attribute) (bionty.DevelopmentalStage attribute) (bionty.Disease attribute) (bionty.Drug attribute) (bionty.Ethnicity attribute) (bionty.ExperimentalFactor attribute) (bionty.Gene attribute) (bionty.Organism attribute) (bionty.Pathway attribute) (bionty.Phenotype attribute) (bionty.Protein attribute) (bionty.Tissue attribute)